Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN3P26045 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms