Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRBP23467 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRBP23467 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRBP23467 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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