Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT15P19012 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT15P19012 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT15P19012 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT15P19012 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT15P19012 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT15P19012 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT15P19012 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT15P19012 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT15P19012 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT15P19012 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms