Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL17P18621 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL17P18621 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL17P18621 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL17P18621 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL17P18621 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL17P18621 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL17P18621 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL17P18621 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL17P18621 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL17P18621 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL17P18621 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL17P18621 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL17P18621 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL17P18621 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL17P18621 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL17P18621 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL17P18621 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL17P18621 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms