Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA1P17302 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA1P17302 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJA1P17302 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJA1P17302 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA1P17302 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA1P17302 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA1P17302 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA1P17302 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA1P17302 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA1P17302 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA1P17302 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA1P17302 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA1P17302 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms