Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCGP05129 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCGP05129 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms