Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
APBA3O96018 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
APBA3O96018 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
APBA3O96018 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
APBA3O96018 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
APBA3O96018 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APBA3O96018 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APBA3O96018 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APBA3O96018 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APBA3O96018 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APBA3O96018 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APBA3O96018 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APBA3O96018 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
APBA3O96018 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APBA3O96018 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APBA3O96018 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APBA3O96018 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APBA3O96018 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
APBA3O96018 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
APBA3O96018 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APBA3O96018 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APBA3O96018 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APBA3O96018 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APBA3O96018 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APBA3O96018 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APBA3O96018 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APBA3O96018 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APBA3O96018 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APBA3O96018 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APBA3O96018 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APBA3O96018 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APBA3O96018 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms