Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1O95476 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1O95476 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms