Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG13O75143 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG13O75143 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG13O75143 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG13O75143 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG13O75143 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG13O75143 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG13O75143 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG13O75143 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG13O75143 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG13O75143 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG13O75143 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG13O75143 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG13O75143 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG13O75143 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG13O75143 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG13O75143 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms