Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PPLO60437 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PPLO60437 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PPLO60437 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PPLO60437 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PPLO60437 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PPLO60437 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PPLO60437 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PPLO60437 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PPLO60437 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PPLO60437 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPLO60437 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPLO60437 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPLO60437 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PPLO60437 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPLO60437 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PPLO60437 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPLO60437 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPLO60437 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PPLO60437 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PPLO60437 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PPLO60437 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PPLO60437 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PPLO60437 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PPLO60437 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PPLO60437 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PPLO60437 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PPLO60437 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPLO60437 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPLO60437 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPLO60437 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPLO60437 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PPLO60437 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PPLO60437 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PPLO60437 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms