Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIF1CO43896 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF1CO43896 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms