Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC13A5PLN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms