Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms