Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms