Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LAPTM4AQ15012 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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