Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms