Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms