Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTF2Q9UNY4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms