Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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