Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COG3Q96JB2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms