Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGF29Q96ES7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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