Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms