Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SNRPG-208ENST00000482975 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL662884.1-201ENST00000559458 662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC009927.1-201ENST00000510501 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC090559.2-201ENST00000366360 430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC02246-201ENST00000412426 991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CLEC4E-206ENST00000545274 730 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC00629-202ENST00000592070 844 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL080317.2-201ENST00000607386 1385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms