Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDAC11Q96DB2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms