Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms