Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms