Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSPA9P38646 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms