Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CRABP1P29762 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CRABP1P29762 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms