Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRCP23327 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRCP23327 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRCP23327 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRCP23327 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRCP23327 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms