Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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