Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARFGAP3Q9NP61 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ARFGAP3Q9NP61 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms