Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATG4DQ86TL0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms