Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms