Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSPNQ14714 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSPNQ14714 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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