Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTCH1Q13635 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms