Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42EP1Q00587 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms