Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC192P0DO97 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms