Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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