Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms