Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GABPAQ06546 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms