Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms