Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK17Q00537 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK17Q00537 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms