Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD3P84022 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms