Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC2P49815 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC2P49815 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSC2P49815 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSC2P49815 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSC2P49815 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSC2P49815 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TSC2P49815 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms