Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMPOP42166 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMPOP42166 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMPOP42166 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms