Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ESRRAP11474 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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