Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2OQ9C0C9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms