Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLT8D2-202ENST00000546436 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASE4-202ENST00000555597 1341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86B2-201ENST00000262365 1268 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP26-202ENST00000380390 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC72-202ENST00000401542 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7P13-201ENST00000415103 741 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT19P5-201ENST00000505620 569 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02499-203ENST00000508147 455 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF22P-201ENST00000508988 1143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026117.1-201ENST00000509658 883 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001636.1-201ENST00000531997 1122 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4K16P-201ENST00000554603 969 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms