Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TINF2Q9BSI4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms