Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCF25Q9BQ70 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF25Q9BQ70 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms